Certains courants de Komodo sont réellement forts. L'eau est poussée à travers d'étroits passages entre les îles au gré des marées, et sur certains sites le résultat ressemble davantage à une rivière en mouvement qu'à une mer tropicale paisible. Ces courants expliquent en partie la richesse du milieu marin : ils transportent les nutriments à travers le parc et contribuent à soutenir tout, du corail aux raies mantas.
Pour les touristes, le danger vient d'une entrée à l'eau au mauvais endroit ou au mauvais moment, ou d'une dérive plus importante que prévu. Les capitaines et guides expérimentés planifient en fonction des tables de marée et de ce qu'ils observent sur l'eau ce jour-là. Ils peuvent déplacer un point d'entrée, raccourcir une session de snorkeling, se replier sur un site abrité ou annuler complètement un site. C'est un bon jugement, pas une excursion décevante.
Si on vous signale qu'un site présente un courant, prenez l'avertissement au pied de la lettre. Restez près du guide, portez un gilet de flottaison si cela est recommandé, et assurez-vous de bien comprendre où le bateau viendra vous récupérer. Ne nagez pas à l'écart du groupe pour suivre un animal, même si l'eau semble d'abord maîtrisable. Les courants peuvent se renforcer rapidement autour des pointes et des chenaux, et la personne la plus en sécurité dans l'eau est généralement celle qui suit le plan local plutôt que d'improviser.

