หากสภาพอากาศเลวร้ายระหว่างทัวร์โคโมโด กัปตันที่มีประสบการณ์จะปรับแผนเพื่อความปลอดภัย ทะเลฟลอเรสขึ้นชื่อในเรื่องสภาพอากาศที่เปลี่ยนแปลงอย่างรวดเร็ว และกัปตันจะคอยติดตามสภาพอากาศอย่างต่อเนื่องผ่านการพยากรณ์ทางทะเล เรดาร์ หากมี และการสังเกตการณ์โดยตรง การตอบสนองอาจมีตั้งแต่การข้ามจุดดำน้ำตื้นและเปลี่ยนอ่าวที่เงียบสงบกว่า ไปจนถึงการชะลอการเดินทาง การเปลี่ยนเส้นทางไปยังน่านน้ำที่มีแนวกำบัง หรือหากจำเป็น ให้กลับไปที่ลาบวนบาโจก่อนกำหนด
เรือที่มีชื่อเสียงมีวิทยุสื่อสาร และบางลำมีโทรศัพท์ผ่านดาวเทียม ช่วยให้กัปตันสามารถประสานงานกับเรือลำอื่น เจ้าหน้าที่ท่าเรือ และฐานทัพของพวกเขาในลาบวนบาโจ ลำดับความสำคัญในการตัดสินใจคือความปลอดภัยของผู้โดยสารเหนือความสมบูรณ์ของแผนการเดินทางเสมอ ในช่วงฤดูฝนตั้งแต่เดือนพฤศจิกายนถึงเมษายน ทะเลที่มีคลื่นลมแรงจะพบเห็นได้บ่อยขึ้น และการยกเลิกหรือการเปลี่ยนแปลงเส้นทางที่สำคัญเกิดขึ้นบ่อยกว่า หากคุณล่องเรือข้ามคืนและสภาพอากาศเลวร้าย ลูกเรือมักจะหาจุดยึดที่มีการป้องกันมากที่สุด รักษาความปลอดภัยของเรือ และรอในสถานการณ์ที่เลวร้ายที่สุด ไม่มีท่าเรือที่ปลอดภัยภายในอุทยานแห่งชาติซึ่งเทียบได้กับลาบวนบาโจ ดังนั้นความสามารถในการดูแลการเดินเรือของเรือและการตัดสินของกัปตันจึงมีความสำคัญ ก่อนจอง ให้สอบถามผู้ให้บริการของคุณว่าพวกเขาจัดการกับเหตุฉุกเฉินด้านสภาพอากาศอย่างไร ทีมงานมืออาชีพจะมีคำตอบที่ชัดเจนและไม่ลังเล

