कोमोडो में शार्क मौजूद हैं, लेकिन उन्हें आम तौर पर पर्यटकों के लिए कोई बड़ा ख़तरा नहीं माना जाता है। स्नॉर्कलर जिन शार्क से सबसे अधिक मुठभेड़ करते हैं वे ब्लैकटिप और व्हाइटटिप रीफ शार्क जैसी रीफ प्रजातियां हैं। ये जानवर अपना समय चट्टानों के आसपास मछलियों का शिकार करने में बिताते हैं और आम तौर पर लोगों से दूरी बनाए रखते हैं। व्यवहार में, कोमोडो में शार्क की तुलना में करंट कहीं अधिक महत्वपूर्ण सुरक्षा मुद्दा है।
इसका मतलब यह नहीं है कि शार्क के साथ लापरवाही से व्यवहार किया जाना चाहिए। वे जंगली जानवर हैं, और आगंतुकों को कभी भी किसी को छूने, खिलाने, पीछा करने या तस्वीर लेने के लिए रोकने का प्रयास नहीं करना चाहिए। यदि कोई शार्क पास से गुजरती है, तो सबसे अच्छी प्रतिक्रिया यह है कि शांत रहें और उसे अपने रास्ते पर चलते रहने दें। बेतहाशा छींटे मारना या उसके पीछे तैरना केवल एक अनावश्यक स्थिति पैदा करता है।
यदि आप शार्क के आसपास असहज महसूस करते हैं, तो पानी में प्रवेश करने से पहले अपने गाइड को बताएं। वे आपको करीब रख सकते हैं, समझा सकते हैं कि साइट पर आम तौर पर कौन सी प्रजातियाँ देखी जाती हैं, और यह तय करने में आपकी मदद कर सकते हैं कि आप इसमें प्रवेश करना चाहते हैं या नहीं। एक अच्छे कोमोडो संचालक को कभी भी किसी पर वन्यजीव मुठभेड़ के लिए दबाव नहीं डालना चाहिए। अधिकांश लोग जो पहले से ही चिंतित रहते हैं, अंततः आश्चर्यचकित हो जाते हैं कि रीफ-शार्क को देखना वास्तव में कितना शांतिपूर्ण लगता है।

