Na łodzi bagaż zwykle przechowuje się w kabinie, więc nie trzeba go ciągle przenosić. Załoga często pomaga przy wejściu/zejściu z łodzi.
W Labuan Bajo przechowalnia bagażu zazwyczaj nie jest problemem: wiele hoteli i guesthouse oferuje przechowanie bagażu przed i po rejsie (czasem bezpłatnie, czasem za małą opłatą). Warto zapytać o to wcześniej w miejscu noclegu.
Podsumowując: zarówno na łodzi, jak i w Labuan Bajo, bezpieczne przechowanie bagażu jest zwykle łatwe do zorganizowania.

