Di atas bot, bagasi anda biasanya disimpan dalam kabin, jadi anda tidak perlu memindahkannya setiap masa. Kru juga sering membantu semasa naik/turun bot.
Di Labuan Bajo, simpanan bagasi biasanya mudah: banyak hotel dan guesthouse boleh menyimpan bag anda sebelum atau selepas trip (kadang‑kadang percuma, kadang‑kadang dengan caj kecil). Sebaiknya tanya penginapan anda lebih awal.
Secara umum, simpan bagasi di Labuan Bajo jarang menjadi masalah besar bagi pelancong.

