Якщо погода погіршується під час туру Комодо, досвідчені капітани коригують план, щоб забезпечити безпеку. Море Флорес відоме швидкими змінами погоди, і капітани безперервно стежать за умовами за допомогою морських прогнозів, радарів, де є, і прямих спостережень. Залежно від серйозності реакція може варіюватися від пропуску відкритого місця для підводного плавання та заміни на більш спокійну бухту до затримки вильоту, зміни маршруту до захищених водойм або, якщо необхідно, повернення раніше в Лабуан Баджо.
Човни з хорошою репутацією оснащені радіостанціями зв’язку, а деякі мають супутникові телефони, що дозволяє капітанам координувати дії з іншими суднами, адміністрацією порту та їх базою в Лабуан Баджо. Пріоритетом прийняття рішень завжди є безпека пасажирів, а не завершення маршруту. Під час дощового сезону з листопада по квітень бурхливе море є більш поширеним явищем, і скасування або значні зміни маршрутів трапляються частіше. Якщо ви відправляєтеся в нічний круїз і погода погіршується, екіпаж зазвичай шукає найбільш захищену доступну стоянку, закріпить судно та перечекає найгірших умов. У самому національному парку немає безпечних гаваней, які можна порівняти з Лабуан Баджо, тому морехідні можливості човна та судження капітана стають критичними. Перш ніж бронювати, запитайте свого оператора, як вони справляються з непередбаченими погодними умовами – професійні екіпажі дадуть чіткі та беззаперечні відповіді.

