Mücken gibt es in den unteren Bereichen des Mount Rinjani, besonders in der Nähe der Startpunkte rund um Sembalun und Senaru, wo das Klima warm und feucht ist. In diesen niedrigeren Lagen bemerken Wanderer oft während der ersten ein bis zwei Stunden des Aufstiegs Mücken, vor allem in bewaldeten oder grasbewachsenen Abschnitten. Ein wenig Insektenschutzmittel zu Beginn der Wanderung reicht normalerweise aus, um sie fernzuhalten.
Mit zunehmender Höhe sinken die Temperaturen, und die Umgebung wird trockener und windiger. Mücken leben nicht in höheren Lagen, daher gibt es spätestens am Kraterrand praktisch keine mehr. An den Campsites der Sembalun- und Senaru-Kraterränder sind Mücken äußerst selten, und am Gipfel existieren sie überhaupt nicht. Die kalten Nachttemperaturen machen ihr Überleben in diesen Höhen unmöglich.
Deshalb beschränkt sich das Mückenproblem größtenteils auf den Beginn und das Ende der Wanderung. Viele Wanderer bringen ein kleines Mückenschutzmittel mit, benötigen es jedoch meist nur im ersten Abschnitt des Trails. Insgesamt sind Mücken auf dem Rinjani eher eine kleine Unannehmlichkeit als ein echtes Problem und verschwinden vollständig, sobald man höher steigt.

