การว่ายน้ำในโคโมโดนั้นปลอดภัยตามจุดท่องเที่ยวทั่วไปหลายแห่ง แต่ไม่ใช่สถานที่ที่คุณควรกระโดดลงน้ำเพียงเพราะมันดูสงบ อุทยานแห่งนี้มีชื่อเสียงในด้านกระแสน้ำที่แรง และบางช่องสามารถพัฒนากระแสน้ำที่ทรงพลังอย่างน่าประหลาดใจ ไกด์ที่ดีจะเลือกสถานที่ว่ายน้ำตามกระแสน้ำและสภาพอากาศในวันนั้น ไม่ใช่แค่ตามรายการสถานที่ท่องเที่ยวที่ตายตัวเท่านั้น
ชายหาดที่ได้รับการคุ้มครองและพื้นที่แนวปะการังน้ำตื้นโดยทั่วไปเป็นสถานที่ที่ง่ายที่สุดสำหรับนักว่ายน้ำทั่วไป หาดสีชมพูและบริเวณที่มีกำบังรอบๆ เกาะ เช่น คานาวะ มักจะให้อภัยได้มากกว่าสถานที่ดำน้ำตื้นแบบโล่งๆ Manta Point เป็นสถานการณ์ที่แตกต่างไปจากเดิมอย่างสิ้นเชิง: กระแสน้ำอาจเป็นส่วนหนึ่งของประสบการณ์ และนักว่ายน้ำจำเป็นต้องฟังไกด์อย่างใกล้ชิดว่าจะเข้าไปที่ใด เรือจะไปรับที่ใด และเงื่อนไขต่างๆ เหมาะสมหรือไม่
ก่อนเข้าไปให้ถามว่าตอนนี้กำลังทำอะไรอยู่ และจะออกจากที่ไหน สวมเสื้อชูชีพหรือเสื้อชูชีพหากคุณรู้สึกไม่สบายตัวเมื่ออยู่ในน้ำเปิด นอกจากนี้ มันยังฉลาดอีกด้วยที่จะอยู่ใกล้ๆ กลุ่ม แทนที่จะไล่เต่าหรือกระเบนราหูไปจากคนอื่นๆ น้ำในโคโมโดเป็นหนึ่งในไฮไลท์ของทริปนี้ แต่การดูแลจุดแวะพักแต่ละจุดด้วยสภาพแวดล้อมที่แตกต่างกันจะปลอดภัยกว่าการคิดว่าอ่าวที่สวยงามทุกแห่งเป็นสระว่ายน้ำที่ใช้งานง่าย

