科莫多岛是公园里最有名的岛,因为这里有数量可观的科莫多巨蜥。岛上的徒步路线通常更长,地形更开阔,整体感觉更偏原始和野性。很多人专程来科莫多岛就是为了在自然环境中看到巨蜥,体验干燥稀树草原与丘陵景观。科莫多岛的“看龙成功率”通常也很高。
林卡岛同样有巨蜥,在某些年份巨蜥密度甚至更高。林卡的地形更偏开阔草地,更容易发现野生动物。徒步通常更短、更轻松,适合不想走太久或偏好更容易路线的游客。很多船宿会把林卡岛作为看巨蜥的重点站点之一。
帕达尔岛则完全不同,因为这里没有巨蜥。帕达尔岛以经典观景点闻名:登顶后可以看到三条弯曲海湾和不同颜色的沙滩,是科莫多最标志性的画面之一。帕达尔岛日出徒步是很多人来科莫多的“必做项目”。大多数3天2晚行程会把这三座岛都安排进去,让你一次体验巨蜥与绝美风景。

