Si la météo se dégrade pendant une excursion à Komodo, les capitaines expérimentés adaptent le programme pour maintenir la sécurité. La mer de Flores est connue pour ses changements météo rapides, et les capitaines surveillent les conditions en permanence grâce aux prévisions marines, au radar lorsqu'il est disponible et à l'observation directe. Selon la gravité, la réponse peut aller de l'abandon d'un site de snorkeling exposé au profit d'une baie plus calme, au report d'un départ, au changement d'itinéraire vers des eaux abritées, ou, si nécessaire, au retour anticipé à Labuan Bajo.
Les bateaux sérieux disposent de radios de communication, et certains ont des téléphones satellites, ce qui permet aux capitaines de se coordonner avec d'autres navires, les autorités portuaires et leur base à Labuan Bajo. La priorité dans la prise de décision est toujours la sécurité des passagers plutôt que le respect du programme. Pendant la saison des pluies, de novembre à avril, les mers agitées sont plus fréquentes, et les annulations ou changements d'itinéraire importants surviennent plus souvent. Si vous êtes sur une croisière de nuit et que le temps se dégrade, l'équipage recherchera généralement le mouillage le plus abrité possible, sécurisera le navire et attendra la fin des conditions les plus difficiles. Il n'existe pas dans le parc national de port sûr comparable à Labuan Bajo, de sorte que la tenue de mer du bateau et le jugement du capitaine deviennent cruciaux. Avant de réserver, demandez à votre opérateur comment il gère les imprévus météo : des équipages professionnels auront des réponses claires et sans hésitation.

