Размер волн на Комодо значительно варьируется в зависимости от сезона, местоположения и повседневной погоды. В засушливый сезон с мая по октябрь волны обычно умеренные, обычно от небольших волн размером менее метра до периодических волн высотой 1–2 метра на открытых участках. В защищенных водах вокруг Лабуан Баджо и близлежащих островов, таких как Ринка и Падар, часто бывают более спокойные условия, подходящие для подводного плавания и комфортного круиза.
В сезон дождей с ноября по апрель волны могут расти больше и быстрее. На участках открытого моря, особенно на переходе Ломбок-Флорес, в периоды штормов могут наблюдаться волны, превышающие 2 метра, а гонка, вызванная ветром, может сделать поездку неровной и влажной. Локализованные погодные системы могут создавать краткосрочные условия, которые отличаются от прогнозов, поэтому капитаны полагаются на опыт не меньше, чем на инструменты.
Внутри самого парка острова служат естественным укрытием, но промежутки между массивами суши позволяют проникать сквозь них. Места для подводного плавания также различаются: некоторые бухты защищены и спокойны, в то время как в других, таких как Манта-Пойнт, могут наблюдаться значительные волнения на поверхности даже в относительно спокойные дни. Волны, которые вы встретите, во многом зависят от вашего маршрута, типа лодки и удачи с погодным окном. Чтобы поездка была максимально плавной, путешествуйте в пик сухого сезона с июля по сентябрь и придерживайтесь маршрутов, основанных на Лабуан Баджо, а не более длительных переходов, если вы чувствительны к движению.

