Komodo National Park er sikker for besøgende, der følger standard forholdsregler og respekterer miljøet. Som et UNESCO-verdensarvssted etableret i 1980, opererer parken under Indonesiens miljø- og skovbrugsministerium med etablerede ranger-protokoller, afmærkede stier og reguleret turismepraksis. Det vigtigste sikkerhedshensyn er selve Komodo-dragen – verdens største firben, med hanner, der når op til 3 meter og 150 kg. Rangers ledsager alle turister på Komodo- og Rinca-øerne, bærer trægaffelpinde til kontrol af publikum og håndhæver strenge regler om afstand og adfærd. Besøgende bliver bedt om at blive hos deres gruppe, undgå at nærme sig eller fodre drager og holde børn under nøje opsyn.
Ud over dyrelivet kræver parkens havmiljø også opmærksomhed. Nogle snorkelsteder som Manta Point oplever stærke strømme og bølger, mens andre såsom Kanawa Island er roligere og bedre egnet til begyndere. Guider overvåger typisk svømmere fra båden eller går selv i vandet. Redningsveste anbefales stærkt, især til mindre selvsikre snorklere. Der er ingen hospitaler på selve øerne – Labuan Bajo tilbyder grundlæggende medicinske faciliteter, og alvorlige nødsituationer kan kræve evakuering til Bali. En rejseforsikring, der dækker medicinsk evakuering, anbefales kraftigt. Terrænet er robust og tørt, med temperaturer på omkring 40°C i den tørre sæson (maj-oktober), så solbeskyttelse, hydrering og ordentligt fodtøj til vandreture som Padar Islands udsigtspunkter er afgørende.

