Park Narodowy Komodo jest bezpieczny dla gości, którzy przestrzegają standardowych środków ostrożności i szanują środowisko. Park, wpisany na Listę Światowego Dziedzictwa UNESCO w 1980 roku, podlega indonezyjskiemu Ministerstwu Środowiska i Leśnictwa, zgodnie z ustalonymi protokołami strażników, oznakowanymi szlakami i regulowanymi praktykami turystycznymi. Najważniejszym czynnikiem bezpieczeństwa jest sam smok z Komodo – największa jaszczurka na świecie, której samce osiągają do 3 metrów i 150 kg wagi. Strażnicy towarzyszą wszystkim turystom na wyspach Komodo i Rinca, noszą drewniane rozwidlone kije w celu kontrolowania tłumu oraz egzekwują surowe zasady dotyczące odległości i zachowania. Odwiedzający proszeni są o pozostanie w grupie, unikanie zbliżania się do smoków i karmienia ich oraz zapewnienie ścisłego nadzoru nad dziećmi.
Oprócz dzikiej przyrody, świadomość morska parku wymaga również świadomości. W niektórych miejscach do snorkelingu, takich jak Manta Point, występują silne prądy i przypływy, podczas gdy inne, takie jak wyspa Kanawa, są spokojniejsze i lepiej dostosowane dla początkujących. Przewodnicy zazwyczaj monitorują pływaków z łodzi lub sami wchodzą do wody. Zdecydowanie zaleca się kamizelki ratunkowe, zwłaszcza dla mniej pewnych siebie osób nurkujących z rurką. Na samych wyspach nie ma szpitali – Labuan Bajo oferuje podstawowe zaplecze medyczne, a poważne sytuacje awaryjne mogą wymagać ewakuacji na Bali. Zdecydowanie zaleca się ubezpieczenie podróżne obejmujące ewakuację medyczną. Teren jest nierówny i suchy, a temperatury sięgają około 40°C w porze suchej (maj–październik), dlatego niezbędna jest ochrona przed słońcem, nawodnienie i odpowiednie obuwie podczas pieszych wędrówek, takich jak punkty widokowe na wyspie Padar.

