Taman Negara Komodo selamat untuk pelawat yang mengikuti langkah berjaga-jaga standard dan menghormati alam sekitar. Sebagai Tapak Warisan Dunia UNESCO yang ditubuhkan pada tahun 1980, taman ini beroperasi di bawah Kementerian Alam Sekitar dan Perhutanan Indonesia dengan protokol renjer yang ditetapkan, laluan bertanda dan amalan pelancongan terkawal. Pertimbangan keselamatan yang paling penting ialah komodo itu sendiri-cicak terbesar di dunia, dengan jantan mencapai sehingga 3 meter dan 150 kg. Renjer menemani semua pelancong di pulau Komodo dan Rinca, membawa kayu bercabang kayu untuk kawalan orang ramai, dan menguatkuasakan peraturan ketat tentang jarak dan tingkah laku. Pelawat diarahkan untuk tinggal bersama kumpulan mereka, elakkan mendekati atau memberi makan naga, dan pastikan kanak-kanak diawasi dengan teliti.
Selain hidupan liar, persekitaran marin taman itu juga memerlukan kesedaran. Beberapa tapak snorkeling seperti Manta Point mengalami arus deras dan lonjakan, manakala yang lain seperti Pulau Kanawa lebih tenang dan lebih sesuai untuk pemula. Pemandu biasanya memantau perenang dari bot atau memasuki air sendiri. Jaket penyelamat sangat disyorkan, terutamanya untuk snorkel yang kurang yakin. Tiada hospital di pulau itu sendiri-Labuan Bajo menawarkan kemudahan perubatan asas, dan kecemasan yang serius mungkin memerlukan pemindahan ke Bali. Insurans perjalanan yang melindungi pemindahan perubatan amat dinasihatkan. Bentuk muka buminya berceranggah dan kering, dengan suhu mencecah sekitar 40°C semasa musim kering (Mei–Oktober), jadi perlindungan matahari, penghidratan dan kasut yang sesuai untuk mendaki seperti sudut pandangan Pulau Padar adalah penting.

