El Parque Nacional de Komodo es seguro para los visitantes que siguen las precauciones habituales y respetan el entorno. Como Patrimonio de la Humanidad de la UNESCO desde 1980, el parque funciona bajo el Ministerio de Medio Ambiente y Silvicultura de Indonesia, con protocolos establecidos para los guardaparques, senderos señalizados y prácticas turísticas reguladas. La consideración de seguridad más importante es el propio dragón de Komodo: el mayor lagarto del mundo, con machos que alcanzan hasta 3 metros y 150 kg. Los guardaparques acompañan a todos los turistas en las islas de Komodo y Rinca, llevan bastones de horquilla de madera para controlar a los grupos y hacen cumplir normas estrictas sobre la distancia y el comportamiento. A los visitantes se les indica que permanezcan con su grupo, no se acerquen ni alimenten a los dragones y vigilen de cerca a los niños.
Más allá de la fauna, el entorno marino también exige atención. Algunos puntos de esnórquel como Manta Point tienen corrientes y resaca fuertes, mientras que otros, como la isla Kanawa, son más tranquilos y mejores para principiantes. Los guías suelen vigilar a los nadadores desde el barco o entran al agua ellos mismos. Se recomiendan encarecidamente los chalecos salvavidas, sobre todo para quienes hacen esnórquel con menos confianza. En las islas no hay hospitales: Labuan Bajo ofrece instalaciones médicas básicas, y las emergencias graves pueden requerir evacuación a Bali. Se aconseja encarecidamente un seguro de viaje que cubra la evacuación médica. El terreno es escarpado y seco, con temperaturas que rondan los 40°C durante la temporada seca (mayo–octubre), por lo que la protección solar, la hidratación y un calzado adecuado para rutas como los miradores de la isla Padar son imprescindibles.

