Los mayores peligros en Komodo son los encuentros con la fauna, las corrientes marinas fuertes, el acceso médico remoto y los riesgos relacionados con el clima. El dragón de Komodo encabeza la lista: los machos alcanzan 3 metros y 150 kg, corren a 20 km/h en ráfagas y tienen mordeduras venenosas cargadas de bacterias. Los guardaparques acompañan a cada grupo, pero el peligro es real si los visitantes ignoran las instrucciones, se acercan a los dragones o se alejan solos. En 2007 se produjo un ataque mortal, y las mordeduras requieren atención médica inmediata.
Las corrientes marinas son el segundo gran peligro. Lugares como Manta Point pueden producir una deriva y un oleaje potentes que desafían incluso a nadadores experimentados. Los guías suelen evaluar las condiciones antes de permitir la entrada al agua, pero el criterio personal importa: nadar más allá de tu capacidad con una corriente fuerte es realmente peligroso. El tercer peligro es el aislamiento. No hay hospitales en ninguna de las islas del parque. Labuan Bajo cuenta con servicios básicos, pero las emergencias graves requieren una evacuación a Bali, lo que lleva tiempo y coordinación. El clima lo agrava todo: el mar de Flores puede volverse agitado rápidamente, sobre todo durante la temporada de lluvias (de noviembre a abril), y las averías del barco o los retrasos con mal tiempo te dejan dependiente de la preparación de la tripulación. Los buenos operadores llevan radios, teléfonos satelitales, chalecos salvavidas y planes de emergencia. Los malos quizá no. Elegir con cuidado es en sí mismo una medida de seguridad.

